Od początku istnienia uczelni Gdański Uniwersytet Medyczny ukończyło ponad 35 tysięcy absolwentów. Są wśród nich wybitni naukowcy i osoby odgrywające pierwszoplanową rolę w życiu społecznym i politycznym kraju. Osiągnięciami swoich absolwentów może pochwalić się każdy z wydziałów GUMed.

Z Gdańskim Uniwersytetem Medycznym związani są m.in.: Anna Dominiczak, córka prof. Joanny Muszkowskiej-Penson oraz prof. Jakuba Pensona, która obecnie pełni funkcję wicedyrektora i kierownika College of Medical, Veterinary and Life Sciences University of Glasgow i Marek Balicki, minister zdrowia w gabinetach Leszka Millera i Marka Belki.

Wielu absolwentów GUMed utrzymuje kontakt z Uczelnią poprzez działalność w Stowarzyszeniu Absolwentów Akademii Medycznej w Gdańsku, które zostało utworzone w 1994 roku, w ramach przygotowań do uroczystości obchodów 50-lecia Uczelni. Inicjatorem powstania Stowarzyszenia był prof. Brunon L. Imieliński.